第1471回生物科学セミナー

Knowledge-based machine learning to extract disease mechanisms from multi-omics data

Saez-Rodriguez, Julio, PhD(Medical Bioinformatics and Data Analysis at the Faculty of Medicine of the University of Heidelberg)

2023年09月25日(月)    15:00-16:30  理学部3号館412号室及びZoom   

Multiomics technologies, specially those with Single-cell and spatial resolution, provide unique opportunities to the key study intra- and inter-cellular processes that drive molecular systems and their deregulation in disease. The use of prior biological knowledge allows us to reduce the dimensionality and increase the interpretability of the data, in particular by extracting from the data features describing the activity of molecular processes such as signaling pathways, gene regulatory networks, and cell-cell communication events. In this talk, I will present resources and methods from our group that combine multi-omic single cell and spatial data with biological knowledge and illustrate them on medically relevant cases.


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担当: 理学系研究科 生物科学専攻 生物情報科学科 黒田研究室  黒田 真也