リンク Links
多様性起源学研究室(野崎研)の関連機関や、研究に役立つWebサイトの一覧です。
機関・学会
大学
- 東京大学 :東京大学公式サイト。
- 理学系研究科 :東京大学大学院理学系研究科の公式サイト。
- 生物科学専攻 ・理学部生物学科 :東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 ・理学部生物学科の公式サイト。
- 多様性起源学研究室 :本研究室の生物科学専攻内サイト(英語)。
国際学会
- IAPT - International Association for Plant Taxonomy :国際植物分類学会。このサイトから国際植物命名規約が読める。
- IPS - International Phycological Society :国際藻類学会。専門誌 Phycologia の発行、IPC (International Phycological Congress) の開催を行う。
- PSA - Phycological Society of America :アメリカ藻類学会。専門誌 Journal of Phycology の発行元。
- Volvocales Information Project :国際ボルボックス会議についての情報。
- Chlamydomonas Connection :クラミドモナスの株情報、プロトコル等が得られる。また2年に一度国際クラミドモナス会議を開催している。
国内学会
- 日本植物学会 :学会情報。植物学用語集など。
- 日本植物分類学会 :学会関連情報。ニュースレターなど。
- 日本植物形態学会 :学会情報。
- 日本藻類学会 :学会情報。デジタル海藻図鑑など。
- 日本微生物資源学会 :学会情報。
- 日本進化学会 :学会関連情報。進化学会ニュースなど。
研究機関
関連分野の研究室
- 日本女子大学 植物生理学研究室 (関本研) :ミカヅキモ、シャジクモの有性生殖や種分化を中心とした研究を行っている。
- お茶の水女子大学 植物資源多様性研究室 (嶌田研) :海洋植物(海草や海藻)の系統分類、分子生物地理、環境適応、保全生態学等を研究している。
培養株保存機関
- Straininfo.net :培養株の保存機関のデータベース。世界中の株保存機関へのリンク、株情報の検索など。
- WDCM :培養株の保存機関のデータベース。世界中の株保存機関へのリンク、株情報の検索など。
- NIES :国立環境研究所の微生物系統保存施設。微細藻類,原生動物などが対象。
- CCAP :イギリスの培養株保存機関。微細藻類,原生動物などが対象。
- SAG :ドイツの Göttingen 大学に属する培養株保存機関。微細藻類が対象。
- CPCC :カナダの培養株保存機関。以前はToronto 大学に属しUTCCと呼ばれていたが、移転改称。微細藻類が対象。
- UTEX :アメリカの Texas 大学に属する培養株保存機関。微細藻類が対象。
- NCMA(旧CCMP) :アメリカのビジェロー海洋科学研究所に属する培養株保存機関。海産の原核生物,菌類,微細藻類などが対象。
その他
- 東京大学附属図書館 :東京大学の付属図書館。外部からも蔵書検索が出来る。
- ゲノム支援 :文部科学省科学研究費新学術領域研究(研究領域提案型)『生命科学系3分野支援活動』、ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援。
- 動植物アロ認証 :新学術領域研究(研究領域提案型)・特定領域研究、動植物に共通するアロ認証機構の解明。
- マトリョーシカ(マトリョーシカ型進化原理) :新学術領域研究(研究領域提案型)・特定領域研究、共生・寄生に駆動されるオルガネラと真核生物の進化を多層空間的に理解することを目指す。
専門誌(ジャーナル)
一般科学誌
- Nature :自然科学一般を扱う雑誌。
- Science :自然科学一般を扱う雑誌。
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA (PNAS) :自然科学一般を扱う雑誌。
- PLOS ONE :自然科学一般を扱うオープンアクセスオンライン雑誌。
分子系統など
- Mol. Biol. Evol. :分子進化や系統、系統解析などを扱う雑誌。
- Mol. Phylogenet. Evol. :様々な生物の分子系統研究を扱う雑誌。
- J. Mol. Evol. :分子進化や系統などを扱う雑誌。
藻類学
- Phycologia :国際藻類学会の学会誌。
- J. Phycol. :アメリカ藻類学会の学会誌。
- Eur. J. Phycol. :イギリスの藻類学会誌。
- Phycol. Res. :日本藻類学会の英文誌。
微生物学全般
- Int. J. Syst. Evol. Microb. :微生物学の国際誌。シアノバクテリアを除く原核生物の命名の場。時に微細藻の論文も。
- J. Eukaryot. Microbiol. :微生物学のうち、真核生物を扱った雑誌。しばしば藻類も含む。
- Protist :原生生物学の専門誌。藻類も含む。
データベース
生物学全般
文献検索
- Google Scholar :オールマイティな文献検索。Advanced Scholar Search も是非。
分類・学名
- ION :ウイルス・真核生物の「学名」のデータベース。命名規約上は非合法な名称もあり。
- The Taxonomicon :生物の分類体系のデータベース。
- Index Nominum Genericorum :植物命名規約のもとで記載された属名のデータベース。
- IPNI :植物の学名のデータベース。
- Index Nominum Algarum :藻類のあらゆるランクの学名のデータベース。
- CyanoDB.cz :シアノバクテリア(藍藻類)の学名のデータベース。
- ZooBank :動物の学名のデータベース。命名規約上は非合法な名称もあり。鞭毛藻類も含まれている。
画像など
- 原生生物図鑑 :原生生物のデータベース。藻類なども含み、写真・情報ともに充実している。
- micro*scope :微生物の顕微鏡写真・イラストのデータベース。
オンライン書店
- Amazon.co.jp :日本国内のオンライン書店最大手の一つ。
- Koeltz Scientific Books :ドイツの自然史専門書店。植物学関連の書籍も充実している。
- BookFinder4U :あらゆる欧文書籍の横断検索ができるサイト。最も安値で取り扱っている書店が調べられる。
系統解析
解説
- きまぐれ生物学 - 系統解析 :野崎研卒業生による、各種系統解析手法の解説。
プログラム
- Clustal: Multiple Sequence Alignment :遺伝子の相同配列を並べるプログラム。無料。最新のClustal Omegaやグラフィカルインターフェイスを備えたClustal Xをダウンロードできる。
- PAUP 4.0 :汎用性の高い系統解析のプログラム。有料。
- jModelTest :系統解析において、塩基配列の進化モデルを推定するためのプログラム。無料。
- MrBayes: Home :ベイズ法を用いた系統解析のプログラム。無料。
- TreeView :PAUP や MrBayes で作成した系統樹を見るためのプログラム。無料。
- PBIL :ClustalX で作成した系統樹を見る NJplot や、作成したアラインメントを編集するための SeaView などが公開されている。無料。
- PhyML :最尤法を用いた系統解析のプログラム。オンラインでの解析可。無料。
- RAxML :最尤法を用いた系統解析のプログラム。オンラインでの解析可。無料。
語学
辞書
- スペースアルク :和英・英和のオンライン辞書。学術用語を含めた幅広い単語に対応し、例文も豊富。
- Weblio英和辞典・和英辞典 :複数の辞書から一度に検索する事ができるオンライン辞書。専門性の高い学術用語も検索できる可能性が高い。
- WebLSD :医学・生化学分野の学術用語に特化したオンライン辞書。よく一緒に使われる単語を検索できる、共起表現検索が便利。
- Latin = English Dictionary :羅英・英羅のオンライン辞書。学名の語源、命名などの参考用に。
翻訳
- WorldLingo - Free Online Translator :オンライン翻訳が出来る。多国語対応で日本語も含む。無料。
英文校閲
- Textcheck :英文の論文の校閲を有償で行うサービス。投稿前に一度。