Link リンク集
多様性起源学研究室 (野崎研) の関連機関や、研究に役立つWebサイトの一覧です。
機関・学会
大学
- 東京大学 ：東京大学公式サイト。
- 理学系研究科 ：東京大学大学院理学系研究科の公式サイト。
- 生物科学専攻 ・理学部生物学科 ：東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 ・理学部生物学科の公式サイト。
- 多様性起源学研究室 ：本研究室の生物科学専攻内サイト（英語）。
国際学会
- IAPT - International Association for Plant Taxonomy ：国際植物分類学会。このサイトから国際植物命名規約が読める。
- IPS - International Phycological Society ：国際藻類学会。専門誌 Phycologia の発行、IPC (International Phycological Congress) の開催を行う。
- PSA - Phycological Society of America ：アメリカ藻類学会。専門誌 Journal of Phycology の発行元。
- International Volvox Conference ：国際ボルボックス会議についての情報。
- Chlamydomonas Connection ：クラミドモナスの株情報、プロトコル等が得られる。また２年に一度国際クラミドモナス会議を開催している。
国内学会
- 日本植物学会 ：学会情報。植物学用語集など。
- 日本植物分類学会 ：学会関連情報。ニュースレターなど。
- 日本植物形態学会 ：学会情報。
- 日本藻類学会 ：学会情報。デジタル海藻図鑑など。
- 日本微生物資源学会 ：学会情報。
- 日本進化学会 ：学会関連情報。進化学会ニュースなど。
研究機関
関連分野の研究室
- 日本女子大学 植物生理学研究室 (関本研) ：ミカヅキモ、シャジクモの有性生殖や種分化を中心とした研究を行っている。
- お茶の水女子大学 植物資源多様性研究室 (嶌田研) ：海洋植物(海草や海藻)の系統分類、分子生物地理、環境適応、保全生態学等を研究している。
培養株保存機関
- Straininfo.net ：培養株の保存機関のデータベース。世界中の株保存機関へのリンク、株情報の検索など。
- WDCM ：培養株の保存機関のデータベース。世界中の株保存機関へのリンク、株情報の検索など。
- NIES ：国立環境研究所の微生物系統保存施設。微細藻類，原生動物などが対象。
- CCAP ：イギリスの培養株保存機関。微細藻類，原生動物などが対象。
- SAG ：ドイツの Göttingen 大学に属する培養株保存機関。微細藻類が対象。
- CPCC ：カナダの培養株保存機関。以前はToronto 大学に属しUTCCと呼ばれていたが、移転改称。微細藻類が対象。
- UTEX ：アメリカの Texas 大学に属する培養株保存機関。微細藻類が対象。
- CCMP ：アメリカのビジェロー海洋科学研究所に属する培養株保存機関。海産の原核生物，菌類，微細藻類などが対象。
その他
- 東京大学附属図書館 ：東京大学の付属図書館。外部からも蔵書検索が出来る。
- ゲノム支援 ：文部科学省科学研究費新学術領域研究（研究領域提案型）『生命科学系３分野支援活動』、ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援。
- 動植物アロ認証 ：新学術領域研究（研究領域提案型）・特定領域研究、動植物に共通するアロ認証機構の解明。
専門誌（ジャーナル）
一般科学誌
- Nature ：自然科学一般を扱う雑誌。
- Science ：自然科学一般を扱う雑誌。
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA (PNAS) ：自然科学一般を扱う雑誌。
- PLOS ONE ：自然科学一般を扱うオープンアクセスオンライン雑誌。
分子系統など
- Mol. Biol. Evol. ：分子進化や系統、系統解析などを扱う雑誌。
- Mol. Phylogenet. Evol. ：様々な生物の分子系統研究を扱う雑誌。
- J. Mol. Evol. ：分子進化や系統などを扱う雑誌。
藻類学
- Phycologia ：国際藻類学会の学会誌。
- J. Phycol. ：アメリカ藻類学会の学会誌。
- Eur. J. Phycol. ：イギリスの藻類学会誌。
- Phycol. Res. ：日本藻類学会の英文誌。
微生物学全般
- Int. J. Syst. Evol. Microb. ：微生物学の国際誌。シアノバクテリアを除く原核生物の命名の場。時に微細藻の論文も。
- J. Eukaryot. Microbiol. ：微生物学のうち、真核生物を扱った雑誌。しばしば藻類も含む。
- Protist ：原生生物学の専門誌。藻類も含む。
データベース
生物学全般
- NCBI ：分子生物学、文献、分類など生物学の様々な情報のデータベースがそろっている。
文献検索
- Google Scholar ：オールマイティな文献検索。Advanced Scholar Search も是非。
分類・学名
- ION ：ウイルス・真核生物の「学名」のデータベース。命名規約上は非合法な名称もあり。
- The Taxonomicon ：生物の分類体系のデータベース。
- Index Nominum Genericorum ：植物命名規約のもとで記載された属名のデータベース。
- IPNI ：植物の学名のデータベース。
- Index Nominum Algarum ：藻類のあらゆるランクの学名のデータベース。
- CyanoDB.cz ：シアノバクテリア（藍藻類）の学名のデータベース。
- ZooBank ：動物の学名のデータベース。命名規約上は非合法な名称もあり。鞭毛藻類も含まれている。
画像など
- 原生生物図鑑 ：原生生物のデータベース。藻類なども含み、写真・情報ともに充実している。
- micro*scope ：微生物の顕微鏡写真・イラストのデータベース。
オンライン書店
- Amazon.co.jp ：日本国内のオンライン書店最大手の一つ。
- Koeltz Scientific Books ：ドイツの自然史専門書店。植物学関連の書籍も充実している。
- BookFinder4U ：あらゆる欧文書籍の横断検索ができるサイト。最も安値で取り扱っている書店が調べられる。
系統解析
解説
- きまぐれ生物学 - 系統解析 ：野崎研卒業生による、各種系統解析手法の解説。
プログラム
- Clustal: Multiple Sequence Alignment ：遺伝子の相同配列を並べるプログラム。無料。最新のClustal Omegaやグラフィカルインターフェイスを備えたClustal Xをダウンロードできる。
- PAUP 4.0 ：汎用性の高い系統解析のプログラム。有料。
- Modeltest ：PAUP などの系統解析において、塩基配列の進化モデルを推定するためのプログラム。無料。PAUP が必要。
- MrBayes: Home ：ベイズ法を用いた系統解析のプログラム。無料。
- TreeView ：PAUP や MrBayes で作成した系統樹を見るためのプログラム。無料。
- PBIL ：ClustalX で作成した系統樹を見る NJplot や、作成したアラインメントを編集するための SeaView などが公開されている。無料。
- PhyML ：最尤法を用いた系統解析のプログラム。オンラインでの解析可。無料。
- RAxML ：最尤法を用いた系統解析のプログラム。オンラインでの解析可。無料。
語学
辞書
- スペースアルク ：和英・英和のオンライン辞書。学術用語を含めた幅広い単語に対応し、例文も豊富。
- Weblio英和辞典・和英辞典 ：複数の辞書から一度に検索する事ができるオンライン辞書。専門性の高い学術用語も検索できる可能性が高い。
- WebLSD ：医学・生化学分野の学術用語に特化したオンライン辞書。よく一緒に使われる単語を検索できる、共起表現検索が便利。
- ハイブリッド アクセス独和辞典 ：独和のオンライン辞書。
- Latin = English Dictionary ：羅英・英羅のオンライン辞書。学名の語源、命名などの参考用に。
翻訳
- WorldLingo - Free Online Translator ：オンライン翻訳が出来る。多国語対応で日本語も含む。無料。
英文校閲
- Textcheck ：英文の論文の校閲を有償で行うサービス。投稿前に一度。
