PUBLICATIONS


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ORAL PRESENTATIONS





  RESEARCH GRANT

(Public grants only)



2017.Jun. - 2021.Mar.
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
"Measuring molecular fluctuations of chordate developmental system and their relationship toward evolutionary conservation"

2017.Jun. - 2021.Mar.
KAKENHI Grant-in-Aid for challenging Exploratory Research, #17K19547:
"Testing possible contribution of maternal microchimeric cells to biliary atresia"

2015.Nov. - 2019.Mar.
Strategic International Collaborative Research Program (SICORP) Japanese-Chinese Research Cooperative Program
"Genetic degree of evolution in Echinoderm and Chordate developmental programs"

2015.Apr. - 2018.Mar. (FY2015-2017)
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

2012.Apr. - 2015. Mar. (FY2012-2014)
KAKENHI Grant-in-Aid for Scientific Research (C), #24570243:
“Evo-Devo understandings of vertebrate embryogenesis” (As a Primary Investigator)

2010. Apr. - 2013. Mar. (FY2010-2012)
KAKENHI Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas, #22128003:
“Developmental changes associated with turtle shell evolution” (As a Co-Investigator)

2011. Apr. - 2012. Mar. (FY2011)
RIKEN President's Discretionary Fund, M10-60030 Designated Program22.
"Emerging view of life from science"

2009. Apr. - 2011. Mar. (FY2009)
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (B) #21710195:
“Revealing molecular entity of phylotypic stage by transcriptome comparison” (As a Primary Investigator)

2007. Apr. - 2008. Mar. (FY2007)
KAKENHI Grant-in-Aid for challenging Exploratory Research, #19657067:
“Identifying and analyzing genes involved in vertebrate developmental constraints” (As a Research Cooperator)

2005. Apr. - 2008. Mar. (FY2005 - FY2007)
JSPS (Japan Society for the Promotion of Science) DC1, #H17-2343:
“Roles of exocytosis related genes in muscle development” (As a Primary Investigator)

KAKENHI, JSPS Research Fellowship for Young Scientists
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  MEETINGS ORGANIZED


2018
The 1st AsiaEvo 発起人
Co-promoter
2017
第50回 日本発生生物学会年会 準備委員(プログラム委員長)
50th meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Chair of Program Committee)
2015
第15回 日本進化学会年会 大会準備委員
15th Meeting of Society of Evolutionary Stdies, Japan (Organizing committee)
2013
第36回 日本分子生物学会年会 組織委員
The 36th Annual meeting of Molecular Biology Society of Japan (Organizing committee)
2012
第35回 日本分子生物学会年会 組織委員(IT委員会)
The 35th Annual meeting of Molecular Biology Society of Japan (IT committee)
2012
第2回 NGS現場の会 副大会長
2012
第1回 NGS現場の会 創設メンバー
2008
第1回 母児間免疫病研究会 発起人
1st meeting of the Materno-Fetal Immune disease
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  TEACHING / LECTURES



講義


東京大学 理学部 生物学科 動物発生学実習 (FY2013-)

東京大学 理学部 生物学科 進化発生生物学 (FY2013-)

東京大学 教養学部前期・後期 進化生物学 (FY2017-)

東京大学 教養学部前期・後期 現代生物学 (FY2017, 2019)

東京大学 全学体験ゼミナール

東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 発生学特論 (FY 2014-)

[Statistics, R] 統計の考え方入門
大阪市立大学医学部 (2018.Jul.15)

Lecture at Kunming Institute of Zoology
"General relationship between ontogeny and phylogeny?" (2015.Sep.28), Kunming, China

[Statistics, R] 数式なしの統計入門と『R』を使った実際
ImageJ + R ハンズオン実習2014 平成26年度NAIST 植物グローバル教育プロジェクト(2014.Jun.12)

[EvoDevo]個体発生は系統発生をくりかえさない
慶應義塾大学 鶴岡キャンパス 概念構築講義 (2014.May.13) 鶴岡 慶應義塾大学

[Bioinformatics] カメ de novo ゲノムとRNAseqデータの異種間比較
第27回 DDBJing講習会 日本DNAデータバンクジャパン(DDBJ)主催 (2013.Jul.4) 三島 国立遺伝学研究所

[Statistics, R lecture] 数式なしの統計講座、そしてRソフトでの実際
やってみようよ!画像、統計、ゲノム・トランスクリプトーム解析ハンズオン実習 (2013.Jul.6) Nara Institute of Science and Technology

[NGS lecture] 新規脊椎動物ゲノム同定とRNAseqによる遺伝子発現プロファイル比較
次世代シーケンシングが切り開く医学研究と展望 (2012.Jul.31) Kyoto University Center for iPS Research and Application

[Bioinformatics lecture] 統計の初歩の初歩 ~検定はRプログラムで全部できます~
入江直樹 インフォマティクスセミナー 京都大学 Center for iPS Cell Research and Application (2012.Jan.19) 京都 [handbill]

[Statistics/Bioinformatics Hands-on lecture] 統計解析ソフトRとその活用:統計の誤用でこけないために
入江直樹 生命情報科学若手の会 沖縄セミナー 2011 (2011.Sep.2) Okinawa

Basic Medicine, Medical Biology course for pre-med students at Daigakuin-Yobiko
(3 classes/week 2008.Aug. - 2009.Mar.)

  Kyoto University Graduate School of Medicine/Biostudies/Science/Agriculture cross sectoral study sessions
(2008.Feb.12, 2008.Nov.14, 2009.Mar.5, all INVITED)



一般公開講演


進化発生生物学って何?
 国際生物オリンピック日本委員会 (2018.Aug.18), 東京

胎児期に刻まれた進化の痕跡
 関東支部公開講演会「塗り替えられる動物の進化の歴史」 (2017.Jul.22nd), 東京

聞こう!語ろう!考えよう! かたちの変化と生きものの進化
 JT生命誌研究館 (2016.Aug.20th), 大阪

第27回東大理学部公開講演会「理学の真実」(2015.Nov.20)
東京大学 理学部オープンキャンパス2015

理化学研究所 参加型サイエンストーク 「見出す」物語 2013


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  PEER REVIEW EXPERIENCES






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  ADVISORY ROLES

AsiaEvo Conference
2016 -
Co-Promoter (with Guojie Zhang, Kinya G Ota, and other scientists)
Journal of Experimental Zology, Part B
2017 Jan -
Associate Editor
Zoological Letters
2016 Jan -
Associate Editor
The Japanese Society of Developmental Biologists
2016 Jan - 2016 Dec
Secretary-general
2013 Jan - 2015 Dec
Deputy secretary-general
Society for Evolutionary studies, Japan
2016 Jan - 2017 Dec
Councilor
2014 Jan - 2015 Dec
Executive member
Japanese Society for Quantitative Biology
2012 Apr - 2015 Apr
core-member
Faculty of 1000
2010 Jul 26 -
Associate Faculty
Study group for Materno-fetal Immune disease
2009 -
Co-Promoter

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  NEWS PAPERS/ MEDIA etc.


日経サイエンス2018年6月号「挑む」 p.8-11

日経新聞、財経新聞、Yahoo!ニュース、BIGLOBEニュース、ライブドアニュース、ニフティニュース etc. (2017.Feb.8)

日経新聞、朝日新聞、毎日新聞、産経新聞、読売新聞、NNNニュース etc. (2013.Apr.29)

研コミュ白書 NGS現場の会 (荒川和晴、入江直樹、谷上賢瑞、中村昇太)

細胞工学 vol.31 No.9 (2012) p.1060-1063 NIKKEI Newspaper

日本経済新聞 (日曜朝刊・科学欄) ~ナゾ科学~ 阿修羅や八岐大蛇、なぜいない? 2011.Jul.10 (in Japanese) >RIKEN Research [PDF] 2011.June Vol.6 Num. 6

科学新聞 4月15日夕刊:「脊椎動物の進化的に保存された発生段階は咽頭胚期 –理研スパコン使って明らかに-」
RIKEN News
2011.Mar.30 (in Japanese)

新学術領域・複合適応形質進化の遺伝子基盤解明 ニュースレター Vol.2 No. S1 号外 [PDF] (in Japanese)



HONGO, TOKYO, JAPAN.


 


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