| 1877年（明治10年） | ［東京大学創立］ |
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| 理学部生物学科設置（東京神田一ツ橋） 小石川植物園理学部に附置 |
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| 1886年（明治19年） | ［帝国大学と改称］ |
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| 理学部動物学科，植物学科設置（本郷へ移転） |
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| 臨海実験所設置（理学部に附置） |
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| 1897年（明治30年） | ［東京帝国大学と改称］ |
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| 植物学科植物園に移転 |
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| 1902年（明治35年） | 植物園日光分園設置（理学部に附置） |
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| 1934年（明治9年） | 理学部 2 号館竣工（動物学科，植物学科移転） |
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| 1939年（明治14年） | 人類学科設置 |
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| 1947年（昭和22年） | ［東京大学と改称］ |
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| 理学部動物学科，植物学科，人類学科 |
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| 1949年（昭和24年） | 理学部生物学科設置（動物学を主とするもの，植物学を主と するもの，人類学を主とするもの） |
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| 1953年（昭和28年） | ［東京大学大学院設置］生物系研究科設置（動物学専攻，植物学専攻，人類学専攻） |
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| 1958年（昭和33年） | 理学部生物化学科設置，大学院生物化学専攻設置 |
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| 1960年（昭和35年） | 理学部 3 号館竣工（生物化学科移転開始） |
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| 1965年（昭和40年） | 大学院理学系研究科設置 |
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| 1983年（昭和58年） | 遺伝子実験施設設置（平成 20 年に理学系研究科に附置） |
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| 1992年（平成4年）〜 1993年（平成5年） | 大学院重点化（教官は大学院専任，学部兼担となる） |
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| 1995年（平成7年） | 理学系研究科生物科学専攻設置（動物科学講座，植物科学講座，人類科学講座， 進化多様性生物学講座，広域理学講座，協力講座， 流動講座） |
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| 2001年（平成13年） | 生物情報科学学部教育特別プログラム開講（5 年間） |
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| 2004年（平成16年） | ［国立大学法人 東京大学となる］ |
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| 2006年（平成18年） | 生物情報科学学部教育プログラム開講（3 年間） |
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| 2007年（平成19年） | 理学部生物情報科学科設置 |
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| 2007年（平成19年）〜2011年（平成13年） | グローバルCOEプログラム「生体シグナルを基盤とする統合生命学」に生物化学専攻および生物科学専攻が参加 |
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| 2014年（平成26年） | 生物化学専攻及び生物科学専攻を統合，新・生物科学専攻となる（生物化学講座，生物学講座，光計測生命学講座， 広域理学講座，協力講座，連携講座） |
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