生物科学セミナー　 第836回 7月18日（水）16：30〜18：00

講演題目：植物の乾燥・低温・塩ストレス応答における全ゲノムトランスクリプトーム解析

講演者名：関　原明（独立行政法人　理化学研究所　植物科学研究センター

　　　　　　　　　　 植物ゲノム発現研究チーム）

講演の概要

植物は移動の自由がないため、乾燥、低温、塩などのストレスに対する独自の適応機構を備えている。これまでにDNAマイクロアレイ法などを用いて、乾燥、低温、塩などのストレスに対して応答する植物遺伝子が多数単離され、それらの機能が同定されつつある。しかしながら、アンチセンスRNA、 non-coding RNA、small RNAやクロマチンリモデリングなどのストレス応答機構における役割に関してはまだ多くの点が不明なままである。

全ゲノムタイリングアレイ解析やSequencing-by-Synthesis (SBS)法を用いた高速シーケンシングシステムによるRNAの大量解析は、全ゲノムトランスクリプトームの解析方法の1つとして最近注目されてきている。今回のセミナーでは、それら最新のトランスクリプトーム解析手法を用いて最近得られた知見について紹介する。

参考文献

1. Seki et al. (2002) Monitoring the expression profiles of  7000 Arabidopsis genes under drought, cold, and high-salinity stresses using a full-length cDNA microarray. Plant J. 31: 279-292.

2. Yamada et al. (2003) Empirical analysis of transcriptional activity in the Arabidopsis genome. Science 302: 842-846.

3. Borsani et al.(2005) Endogenous siRNAs derived from a pair of natural cis-antisense transcripts regulate salt tolerance in Arabidopsis. Cell 123: 1279–1291.

4. Meyers et al. (2006) Sweating the small stuff: microRNA discovery in plants. Curr. Opin. Plant Biotechnol. 17:139-146.

5. Seki et al. (2007) Regulatory metabolic networks in drought stress responses. Curr. Opin. Plant Biol. 10:296-302.

理学部生物学科植物学コース